മൗസ് ജെനോടൈപ്പിംഗ് കിറ്റ്
പൂച്ച നമ്പർ: HCR2021A
ഡിഎൻഎ ക്രൂഡ് എക്സ്ട്രാക്ഷൻ, പിസിആർ ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ സിസ്റ്റം എന്നിവയുൾപ്പെടെ മൗസിൻ്റെ ജനിതകരൂപങ്ങളുടെ ദ്രുതഗതിയിലുള്ള തിരിച്ചറിയലിനായി രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്ന ഒരു കിറ്റാണ് ഈ ഉൽപ്പന്നം.Lysis Buffer, Proteinase k എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് ലളിതമായ പിളർപ്പിന് ശേഷം മൗസ് ടെയിൽ, ചെവി, കാൽവിരലുകൾ, മറ്റ് ടിഷ്യുകൾ എന്നിവയിൽ നിന്ന് നേരിട്ട് PCR ആംപ്ലിഫിക്കേഷനായി ഉൽപ്പന്നം ഉപയോഗിക്കാം.ഒറ്റരാത്രികൊണ്ട് ദഹനം, ഫിനോൾ-ക്ലോറോഫോം വേർതിരിച്ചെടുക്കൽ അല്ലെങ്കിൽ കോളം ശുദ്ധീകരണം എന്നിവയില്ല, ഇത് ലളിതവും പരീക്ഷണങ്ങളുടെ സമയം കുറയ്ക്കുന്നതുമാണ്.2kb വരെ ടാർഗെറ്റ് ശകലങ്ങൾ വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നതിനും 3 ജോഡി പ്രൈമറുകൾ ഉള്ള മൾട്ടിപ്ലക്സ് PCR പ്രതികരണങ്ങൾക്കും ഉൽപ്പന്നം അനുയോജ്യമാണ്.2×മൗസ് ടിഷ്യൂ ഡയറക്ട് പിസിആർ മിക്സിൽ ജനിതകപരമായി രൂപകൽപ്പന ചെയ്ത ഡിഎൻഎ പോളിമറേസ്, എംജി അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.2+, dNTP-കളും ഉയർന്ന ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ കാര്യക്ഷമതയും ഇൻഹിബിറ്റർ ടോളറൻസും നൽകുന്നതിനുള്ള ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്ത ബഫർ സിസ്റ്റവും, അതുവഴി ടെംപ്ലേറ്റും പ്രൈമറുകളും ചേർത്ത് ഉൽപ്പന്നത്തെ 1× ആയി റീഹൈഡ്രേറ്റ് ചെയ്തുകൊണ്ട് PCR പ്രതികരണങ്ങൾ നടത്താം.ഈ ഉൽപ്പന്നം ഉപയോഗിച്ച് വർദ്ധിപ്പിച്ച PCR ഉൽപ്പന്നത്തിന് 3′ അറ്റത്ത് ഒരു പ്രമുഖ "A" ബേസ് ഉണ്ട്, ശുദ്ധീകരണത്തിന് ശേഷം TA ക്ലോണിംഗിനായി നേരിട്ട് ഉപയോഗിക്കാം.
ഘടകങ്ങൾ
ഘടകം | വലിപ്പം |
2×മൗസ് ടിഷ്യു ഡയറക്ട് പിസിആർ മിക്സ് | 5×1.0mL |
ലിസിസ് ബഫർ | 2×20mL |
പ്രോട്ടീനസ് കെ | 800μL |
സംഭരണ വ്യവസ്ഥകൾ
ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ -25~-15℃ 2 വർഷത്തേക്ക് സൂക്ഷിക്കണം.ഉരുകിയ ശേഷം, ഹ്രസ്വകാല ഒന്നിലധികം ഉപയോഗത്തിനായി ലിസിസ് ബഫർ 2~8℃-ൽ സൂക്ഷിക്കാം, ഉപയോഗിക്കുമ്പോൾ നന്നായി ഇളക്കുക.
അപേക്ഷ
ഈ ഉൽപ്പന്നം മൗസ് നോക്കൗട്ട് വിശകലനം, ട്രാൻസ്ജെനിക് കണ്ടെത്തൽ, ജനിതകമാറ്റം തുടങ്ങിയവയ്ക്ക് അനുയോജ്യമാണ്.
ഫീച്ചറുകൾ
1.ലളിതമായ പ്രവർത്തനം: ജീനോമിക് ഡിഎൻഎ വേർതിരിച്ചെടുക്കേണ്ട ആവശ്യമില്ല;
2.വൈഡ് ആപ്ലിക്കേഷൻ: വിവിധ മൗസ് ടിഷ്യൂകളുടെ നേരിട്ടുള്ള വർദ്ധനവിന് അനുയോജ്യമാണ്.
നിർദ്ദേശങ്ങൾ
1.ജീനോമിക് ഡിഎൻഎയുടെ പ്രകാശനം
1) ലൈസേറ്റ് തയ്യാറാക്കൽ
ലൈസ് ചെയ്യേണ്ട മൌസ് സാമ്പിളുകളുടെ എണ്ണം അനുസരിച്ചാണ് ടിഷ്യു ലൈസേറ്റ് തയ്യാറാക്കുന്നത് (ഡോസ് അനുസരിച്ച് ടിഷ്യു ലൈസേറ്റ് ഓൺ-സൈറ്റിൽ തയ്യാറാക്കുകയും ഉപയോഗത്തിനായി നന്നായി കലർത്തുകയും വേണം), ഒരു സാമ്പിളിന് ആവശ്യമായ റിയാക്ടറുകളുടെ അനുപാതം ഇപ്രകാരമാണ്:
ഘടകങ്ങൾ | വോളിയം (μL) |
പ്രോട്ടീനസ് കെ | 4 |
ലിസിസ് ബഫർ | 200 |
2) സാമ്പിൾ തയ്യാറാക്കലും ലിസിസും
ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന ടിഷ്യു ഉപയോഗം
തരംടിഷ്യു | ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന വോളിയം |
മൗസ് വാൽ | 1-3 മി.മീ |
മൗസ് ചെവി | 2-5 മി.മീ |
മൗസ് വിരൽ | 1-2 കഷണങ്ങൾ |
വൃത്തിയുള്ള സെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബുകളിൽ ഉചിതമായ അളവിൽ മൗസ് ടിഷ്യു സാമ്പിളുകൾ എടുക്കുക, ഓരോ സെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബിലും 200μL ഫ്രഷ് ടിഷ്യൂ ലൈസേറ്റ് ചേർക്കുക, ചുഴലിക്കാറ്റ് കുലുക്കുക, തുടർന്ന് 55 ഡിഗ്രിയിൽ 30 മിനിറ്റ് ഇൻകുബേറ്റ് ചെയ്യുക, തുടർന്ന് 98 ഡിഗ്രിയിൽ 3 മിനിറ്റ് ചൂടാക്കുക.
3) സെൻട്രിഫ്യൂഗേഷൻ
ലൈസേറ്റ് നന്നായി കുലുക്കി 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ 5 മിനിറ്റ് സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക.പിസിആർ ആംപ്ലിഫിക്കേഷനുള്ള ടെംപ്ലേറ്റായി സൂപ്പർനാറ്റൻ്റ് ഉപയോഗിക്കാം.സംഭരണത്തിനായി ടെംപ്ലേറ്റ് ആവശ്യമാണെങ്കിൽ, സൂപ്പർനാറ്റൻ്റ് മറ്റൊരു അണുവിമുക്തമായ സെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബിലേക്ക് മാറ്റി -20℃-ൽ 2 ആഴ്ചത്തേക്ക് സൂക്ഷിക്കുക.
2.പിസിആർ ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ
-20℃-ൽ നിന്ന് 2×മൗസ് ടിഷ്യൂ ഡയറക്റ്റ് പിസിആർ മിക്സ് നീക്കം ചെയ്ത് ഐസിൽ ഉരുകുക, തലകീഴായി ഇളക്കുക, താഴെപ്പറയുന്ന പട്ടിക പ്രകാരം PCR പ്രതികരണ സംവിധാനം തയ്യാറാക്കുക (ഐസിൽ പ്രവർത്തിക്കുക):
ഘടകങ്ങൾ | 25μLസിസ്റ്റം | 50μLസിസ്റ്റം | അന്തിമ ഏകാഗ്രത |
2×മൗസ് ടിഷ്യു ഡയറക്ട് പിസിആർ മിക്സ് | 12.5μL | 25μL | 1× |
പ്രൈമർ 1 (10μM) | 1.0μL | 2.0μL | 0.4μM |
പ്രൈമർ 2 (10μM) | 1.0μL | 2.0μL | 0.4μM |
പിളർപ്പ് ഉൽപ്പന്നംa | ആവശ്യാനുസരണം | ആവശ്യാനുസരണം |
|
ddH2O | 25μL വരെ | 50μL വരെ |
|
കുറിപ്പ്:
a) ചേർത്ത തുക സിസ്റ്റത്തിൻ്റെ 1/10 കവിയാൻ പാടില്ല, കൂടുതൽ ചേർത്താൽ, PCR ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ തടസ്സപ്പെട്ടേക്കാം.
ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന PCR വ്യവസ്ഥകൾ
സൈക്കിൾ ഘട്ടം | താൽക്കാലികം. | സമയം | സൈക്കിളുകൾ |
പ്രാരംഭ ഡീനാറ്ററേഷൻ | 94℃ | 5 മിനിറ്റ് | 1 |
ഡീനാറ്ററേഷൻ | 94℃ | 30 സെക്കൻഡ് | 35-40 |
അനീലിംഗ്a | Tm+3~5℃ | 30 സെക്കൻഡ് | |
വിപുലീകരണം | 72℃ | 30 സെക്കൻഡ്/കെബി | |
അന്തിമ വിപുലീകരണം | 72℃ | 5 മിനിറ്റ് | 1 |
- | 4℃ | പിടിക്കുക | - |
കുറിപ്പ്:
എ) അനീലിംഗ് താപനില: പ്രൈമറിൻ്റെ Tm മൂല്യത്തെ പരാമർശിച്ച്, അനീലിംഗ് താപനില പ്രൈമറിൻ്റെ ചെറിയ Tm മൂല്യത്തിലേക്ക് സജ്ജീകരിക്കാൻ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു +3~5℃.
പൊതുവായ പ്രശ്നങ്ങളും പരിഹാരങ്ങളും
1.ടാർഗെറ്റുചെയ്ത സ്ട്രിപ്പുകളൊന്നുമില്ല
1) അമിതമായ ലിസിസ് ഉൽപ്പന്നം.ഏറ്റവും അനുയോജ്യമായ ടെംപ്ലേറ്റ് തിരഞ്ഞെടുക്കുക, സാധാരണയായി സിസ്റ്റത്തിൻ്റെ 1/10-ൽ കൂടരുത്;
2) സാമ്പിൾ വലുപ്പം വളരെ വലുതാണ്.ലൈസേറ്റ് 10 തവണ നേർപ്പിക്കുക, തുടർന്ന് ആംപ്ലിഫൈ ചെയ്യുക, അല്ലെങ്കിൽ സാമ്പിൾ വലുപ്പം കുറയ്ക്കുകയും വീണ്ടും ലിസിസ് ചെയ്യുകയും ചെയ്യുക;
3) ടിഷ്യു സാമ്പിളുകൾ പുതിയതല്ല.പുതിയ ടിഷ്യു സാമ്പിളുകൾ ഉപയോഗിക്കാൻ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു;
4) മോശം പ്രൈമർ ഗുണനിലവാരം.പ്രൈമർ ഗുണനിലവാരം പരിശോധിക്കുന്നതിനും പ്രൈമർ ഡിസൈൻ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യുന്നതിനും ആംപ്ലിഫിക്കേഷനായി ജീനോമിക് ഡിഎൻഎ ഉപയോഗിക്കുക.
2.നോൺ-സ്പെസിഫിക് ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ
1) അനീലിംഗ് താപനില വളരെ കുറവാണ്, സൈക്കിൾ നമ്പർ വളരെ കൂടുതലാണ്.അനീലിംഗ് താപനില വർദ്ധിപ്പിക്കുകയും സൈക്കിളുകളുടെ എണ്ണം കുറയ്ക്കുകയും ചെയ്യുക;
2) ടെംപ്ലേറ്റ് കോൺസൺട്രേഷൻ വളരെ കൂടുതലാണ്.ടെംപ്ലേറ്റിൻ്റെ അളവ് കുറയ്ക്കുക അല്ലെങ്കിൽ ആംപ്ലിഫിക്കേഷന് ശേഷം ടെംപ്ലേറ്റ് 10 തവണ നേർപ്പിക്കുക;
3) മോശം പ്രൈമർ പ്രത്യേകത.പ്രൈമർ ഡിസൈൻ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യുക.
കുറിപ്പുകൾ
1.സാമ്പിളുകൾക്കിടയിൽ മലിനീകരണം ഉണ്ടാകാതിരിക്കാൻ, ഒന്നിലധികം സാംപ്ലിംഗ് ടൂളുകൾ തയ്യാറാക്കണം, ആവർത്തിച്ചുള്ള ഉപയോഗം ആവശ്യമെങ്കിൽ ഉപകരണങ്ങളുടെ ഉപരിതലം 2% സോഡിയം ഹൈപ്പോക്ലോറൈറ്റ് ലായനി അല്ലെങ്കിൽ ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് ക്ലീനർ ഉപയോഗിച്ച് വൃത്തിയാക്കാം.
2.പുതിയ മൗസ് ടിഷ്യൂകൾ ഉപയോഗിക്കാൻ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു, ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ഫലങ്ങളെ ബാധിക്കാതിരിക്കാൻ സാമ്പിൾ വോളിയം വളരെ വലുതായിരിക്കരുത്.
3.ലൈസിസ് ബഫർ ഫ്രീസ്-ഥോവ് ഒഴിവാക്കണം, ഹ്രസ്വകാല ഒന്നിലധികം ഉപയോഗത്തിനായി 2~8℃-ൽ സൂക്ഷിക്കാം.കുറഞ്ഞ താപനിലയിൽ സംഭരിച്ചാൽ, മഴ ഉണ്ടാകാം, ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് പൂർണ്ണമായും അലിഞ്ഞുപോകണം.
4.PCR മിക്സ് ഇടയ്ക്കിടെ ഫ്രീസ്-ഥോ ഒഴിവാക്കണം, ഹ്രസ്വകാല ആവർത്തിച്ചുള്ള ഉപയോഗത്തിനായി 4 ഡിഗ്രിയിൽ സൂക്ഷിക്കാം.
5.ഈ ഉൽപ്പന്നം ശാസ്ത്രീയ പരീക്ഷണ ഗവേഷണത്തിന് മാത്രമുള്ളതാണ്, ഇത് ക്ലിനിക്കൽ രോഗനിർണയത്തിനോ ചികിത്സയിലോ ഉപയോഗിക്കാൻ പാടില്ല.