ഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ മിനി കിറ്റ്
ഈ കിറ്റ് ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്ത ബഫർ സിസ്റ്റവും സിലിക്ക ജെൽ കോളം പ്യൂരിഫിക്കേഷൻ ടെക്നോളജിയും സ്വീകരിക്കുന്നു, TAE അല്ലെങ്കിൽ TBE അഗറോസ് ജെല്ലിൻ്റെ വിവിധ സാന്ദ്രതകളിൽ നിന്ന് 70 bp - 20 kb ഡിഎൻഎ ശകലങ്ങൾ വീണ്ടെടുക്കാനാകും.ഡിഎൻഎ അഡോർപ്ഷൻ കോളം ഉയർന്ന ഉപ്പ് അവസ്ഥയിൽ ഡിഎൻഎയെ പ്രത്യേകമായി ആഗിരണം ചെയ്യാൻ കഴിയും.കൂടാതെ, കിറ്റിന് പിസിആർ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ, എൻസൈമാറ്റിക് റിയാക്ഷൻ സിസ്റ്റങ്ങൾ അല്ലെങ്കിൽ മറ്റ് രീതികളിലൂടെ ലഭിച്ച ക്രൂഡ് ഡിഎൻഎ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ എന്നിവയിൽ നിന്നുള്ള ഡിഎൻഎ ശകലങ്ങൾ നേരിട്ട് ശുദ്ധീകരിക്കാനും പ്രോട്ടീനുകൾ, മറ്റ് ഓർഗാനിക് സംയുക്തങ്ങൾ, അജൈവ ഉപ്പ് അയോണുകൾ, ഒലിഗോ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പ്രൈമറുകൾ തുടങ്ങിയ മാലിന്യങ്ങൾ നീക്കം ചെയ്യാനും കഴിയും.10-15 മിനിറ്റിനുള്ളിൽ ശുദ്ധീകരണം പൂർത്തിയാക്കാൻ കഴിയുമെന്ന് ഇത് ഉറപ്പാക്കാൻ കഴിയും.ശുദ്ധീകരിക്കപ്പെട്ട ഡിഎൻഎ നേരിട്ട് ലിഗേഷൻ, പരിവർത്തനം, എൻസൈം ദഹനം, ഇൻ വിട്രോ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ, പിസിആർ, സീക്വൻസിങ്, മൈക്രോ ഇൻജക്ഷൻ മുതലായവയ്ക്ക് ഉപയോഗിക്കാം.
സംഭരണ വ്യവസ്ഥകൾ
-15 ~ -25 ഡിഗ്രി സെൽഷ്യസിൽ സംഭരിക്കുകയും ഊഷ്മാവിൽ കൊണ്ടുപോകുകയും ചെയ്യുക.
ഘടകങ്ങൾ
ഘടകങ്ങൾ | (100 rxns) |
ബഫർ ജിഡിപി | 80 മില്ലി |
ബഫർ GW | 2 × 20 മില്ലി |
എല്യൂഷൻ ബഫർ | 20 മില്ലി |
FastPure DNA മിനി നിരകൾ-G | 100 |
ബഫർ ജിഡിപി:ഡിഎൻഎ ബൈൻഡിംഗ് ബഫർ.
ബഫർ GW:വാഷിംഗ് ബഫർ;ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് കുപ്പിയിൽ സൂചിപ്പിച്ചിരിക്കുന്ന അളവിൽ സമ്പൂർണ്ണ എത്തനോൾ ചേർക്കുക.
എല്യൂഷൻ ബഫർ:എല്യൂഷൻ.
FastPure DNA മിനി നിരകൾ-G:ഡിഎൻഎ അഡോർപ്ഷൻ നിരകൾ.
ശേഖരണ ട്യൂബുകൾ 2 മില്ലി:ഫിൽട്രേറ്റിനുള്ള ശേഖരണ ട്യൂബുകൾ.
തയ്യാറാക്കിയ മെറ്റീരിയലുകൾ
1.5 മില്ലി അണുവിമുക്തമാക്കിയ ട്യൂബുകൾ, കേവല എത്തനോൾ, ഐസോപ്രൊപനോൾ (ഡിഎൻഎ ശകലം ≤100 ബിപി ആകുമ്പോൾ, 1 വോള്യം ചേർക്കുക
ഐസോപ്രോപനോൾ 1 വോള്യം ജെൽ വരെ), വാട്ടർ ബാത്ത്.
പരീക്ഷണ പ്രക്രിയ
ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് ടാഗിൽ സൂചിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ ബഫർ GW നേർപ്പിക്കാൻ 80 മില്ലി എത്തനോൾ ചേർക്കുക, ഊഷ്മാവിൽ സൂക്ഷിക്കുക.
മെക്കാനിസം
1. പിസിആർ പ്രതികരണ പരിഹാരം
ജെൽ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ സ്കീം: തുല്യ വോളിയം ബഫർ ജിഡിപി പിസിആർ പ്രതികരണ പരിഹാരം വീണ്ടെടുക്കൽ സ്കീം ചേർക്കുക:വോളിയത്തിൻ്റെ 5 മടങ്ങ് ബഫർ ചേർക്കുക
2. ജിഡിപി ജെല്ലിൻ്റെ അളവ് കണക്കാക്കുക (100 μl 100 മില്ലിഗ്രാമിന് തുല്യമാണ്)
ജെൽ പിരിച്ചുവിടുക
3. 50-55 വരെ ചൂടാക്കുക℃
4. ബൈൻഡ് വാഷ്
ബഫർ ജിഡിപിയുടെ 300 μL ചേർക്കുക*
700 μL ബഫർ GW ചേർക്കുക
700 μL ബഫർ GW ചേർക്കുക
5. എലൂട്ട്
20 - 30μL എല്യൂഷൻ ബഫർ അല്ലെങ്കിൽ ഡീയോണൈസ്ഡ് വെള്ളം ചേർക്കുക
കുറിപ്പുകൾ* ഈ ഘട്ടം കൂടാതെ PCR പ്രതികരണ ദ്രാവകം വീണ്ടെടുക്കൽ
ജെൽ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ പ്രോഗ്രാം
1. ഡിഎൻഎ ശകലങ്ങൾ ഭിന്നിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള ഡിഎൻഎ ഇലക്ട്രോഫോറെസിസിനു ശേഷം, അഗാറോസ് ജെല്ലിൽ നിന്ന് അൾട്രാവയലറ്റ് ലൈറ്റിന് കീഴിൽ ഡിഎൻഎ ശകലത്തിൻ്റെ ഒറ്റ വര എക്സൈസ് ചെയ്യുക.ജെല്ലിൻ്റെ പ്രത്യക്ഷമായ ഈർപ്പം ആഗിരണം ചെയ്യാനും കഴിയുന്നത്ര അധിക അഗറോസ് നീക്കം ചെയ്തുകൊണ്ട് ജെൽ സ്ലൈസിൻ്റെ വലുപ്പം കുറയ്ക്കാനും ആഗിരണം ചെയ്യാവുന്ന പേപ്പർ ഉപയോഗിക്കാൻ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു.അതിൻ്റെ അളവ് കണക്കാക്കാൻ ജെൽ സ്ലൈസ് (മൈക്രോസെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബ് ഇല്ലാതെ) തൂക്കുക: 100 മില്ലിഗ്രാം ജെൽസ്ലൈസിൻ്റെ അളവ് ഏകദേശം 100 μL ആണ്, സാന്ദ്രത 1g/ml ആണെന്ന് കരുതുക.
2. തുല്യ വോളിയം ബഫർ ജിഡിപി ചേർക്കുക, 7-10 മിനിറ്റ് 50~55℃ ഇൻകുബേറ്റ് ചെയ്യുക (ജെൽ വലുപ്പം അനുസരിച്ച്, ജെൽ പൂർണ്ണമായും അലിഞ്ഞുപോകുന്നതുവരെ ഇൻകുബേഷൻ സമയം ക്രമീകരിക്കുക).ഇൻകുബേഷൻ സമയത്ത് ട്യൂബ് 2 തവണ തിരിക്കുക.
Δ ബഫർ ജിഡിപിയുടെ 1-3 വോള്യങ്ങൾ ചേർക്കുന്നത് ഡിഎൻഎ വീണ്ടെടുക്കൽ കാര്യക്ഷമതയെ ബാധിക്കില്ല.ഡിഎൻഎ ശകലം വീണ്ടെടുക്കണമെങ്കിൽ <100 ബിപി, ബഫർ ജിഡിപിയുടെ 3 വാല്യങ്ങൾ ചേർക്കേണ്ടതുണ്ട്;ജെൽ സ്ലൈസ് പൂർണ്ണമായും അലിഞ്ഞുപോകുമ്പോൾ, 1 വോള്യം ഐസോപ്രോപനോൾ ചേർത്ത് നന്നായി ഇളക്കുക, തുടർന്ന് അടുത്ത ഘട്ടത്തിലേക്ക് തുടരുക.
3. ട്യൂബിൻ്റെ അടിയിലേക്ക് സാമ്പിൾ കൊണ്ടുവരാൻ സംക്ഷിപ്തമായി സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക, 2 മില്ലി കളക്ഷൻ ട്യൂബുകളിലേക്ക് ഫാസ്റ്റ്പ്യുവർ ഡിഎൻഎ മിനി കോളംസ്-ജി തിരുകുക, ലായനി പരമാവധി 700 μL ഒരു പ്രാവശ്യം ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം കൈമാറുക.
ഫിൽട്ടറേഷൻ നിരകളിലേക്കുള്ള സമയം, 30-60 സെക്കൻ്റിനുള്ള 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ (13,800 X g) അപകേന്ദ്രബലം.
4. ഫിൽട്രേറ്റ് ഉപേക്ഷിച്ച് കോളത്തിലേക്ക് 300 μL ബഫർ GDP ചേർക്കുക, 1 മിനിറ്റ് ഊഷ്മാവിൽ ഇൻകുബേറ്റ് ചെയ്യുക, 12,000 rpm-ൽ (13,800 X g) സെൻട്രിഫ്യൂജ് 30-60 സെക്കൻ്റ്.
5. ഫിൽട്രേറ്റ് ഉപേക്ഷിച്ച്, കോളത്തിലേക്ക് 700 μL ബഫർ GW ചേർക്കുക (മുൻകൂട്ടി എഥനോൾ ചേർത്തിട്ടുണ്ടോയെന്ന് പരിശോധിക്കുക!), 30-60 സെക്കൻഡ് നേരത്തേക്ക് 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ (13,800 X g) സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക.
Δ അഡോർപ്ഷൻ കോളത്തിൻ്റെ ചുവരിന് ചുറ്റും ബഫർ GW ചേർക്കുക, അല്ലെങ്കിൽ ബഫർ GW ബാക്ക് കവർ ചേർത്ത് 2 - 3 തവണ തലകീഴായി മിക്സ് ചെയ്യുക, ഇത് ട്യൂബ് ഭിത്തിയോട് ചേർന്നിരിക്കുന്ന ഉപ്പ് പൂർണ്ണമായും ഫ്ലഷ് ചെയ്യാൻ സഹായിക്കും.
6. ഘട്ടം 5 ആവർത്തിക്കുക.
Δ രണ്ട് തവണ ബഫർ GW ഉപയോഗിച്ച് ഫ്ലഷ് ചെയ്യുന്നത് ഉപ്പ് പൂർണ്ണമായും നീക്കം ചെയ്യപ്പെടുകയും തുടർന്നുള്ള പരീക്ഷണങ്ങളിൽ ആഘാതം ഇല്ലാതാക്കുകയും ചെയ്യും.
7. ഫിൽട്രേറ്റ് ഉപേക്ഷിച്ച് ശൂന്യമായ കോളം 2 മിനിറ്റ് നേരത്തേക്ക് 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ (13,800 X g) സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക.
8. വൃത്തിയുള്ള 1.5 മില്ലി മൈക്രോസെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബിലേക്ക് കോളം തിരുകുക, കോളം മെംബ്രണിൻ്റെ മധ്യഭാഗത്ത് 20 - 30 μL എല്യൂഷൻ ബഫർ ചേർക്കുക, 2 മിനിറ്റ് ഇൻകുബേറ്റ് ചെയ്യുക, തുടർന്ന് 1 മിനിറ്റിന് 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ (13,800 X g) സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക.കോളം ഉപേക്ഷിക്കുക, ലഭിച്ച ഡിഎൻഎ -20 ൽ സൂക്ഷിക്കുക.
Δ സ്റ്റെപ്പ് 8-ൻ്റെ സൂപ്പർനാറ്റൻ്റ് വീണ്ടും എല്യൂട്ടുചെയ്യാൻ കോളത്തിലേക്ക് മാറ്റുകയും എല്യൂഷൻ ബഫർ 55-ലേക്ക് പ്രീ-ഹീറ്റ് ചെയ്യുകയും (ഡിഎൻഎ ശകലം > 3 കെബി ആകുമ്പോൾ) വീണ്ടെടുക്കൽ കാര്യക്ഷമത വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നതിന് സഹായകമായേക്കാം.
PCR ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ വീണ്ടെടുക്കൽ പ്രോഗ്രാം
പിസിആർ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ, എൻസൈമാറ്റിക് റിയാക്ഷൻ സിസ്റ്റം, മറ്റ് ഡിഎൻഎ ക്രൂഡ് ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ (ജനിതക ഡിഎൻഎ ഉൾപ്പെടെ) എന്നിവയിൽ നിന്നുള്ള ഡിഎൻഎ ശകലങ്ങൾ ശുദ്ധീകരിക്കുന്നതിന് ഈ പ്രോട്ടോക്കോൾ ബാധകമാണ്.ഈ പരിഹാരത്തിന് വിവിധ ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ, പ്രൈമറുകൾ, പ്രൈമർ ഡൈമറുകൾ, ഉപ്പ് തന്മാത്രകൾ, എൻസൈമുകൾ, മറ്റ് മാലിന്യങ്ങൾ എന്നിവ ഫലപ്രദമായി നീക്കംചെയ്യാൻ കഴിയും.
1. ചുരുക്കത്തിൽ സെൻട്രിഫ്യൂജ് PCR ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ, എൻസൈമാറ്റിക് പ്രതികരണ പരിഹാരം, മറ്റ് ഡിഎൻഎ ക്രൂഡ് ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ.പൈപ്പറ്റ് ഉപയോഗിച്ച് അവയുടെ അളവ് കണക്കാക്കുക, അണുവിമുക്തമാക്കിയ 1.5 മില്ലി അല്ലെങ്കിൽ 2 മില്ലി ട്യൂബിലേക്ക് മാറ്റുക.100 μL വരെ വോളിയം വരെ ddH2O ചേർക്കുക;ഉയർന്ന സാന്ദ്രതയുള്ള ജനിതക ഡിഎൻഎയ്ക്ക്, ddH2O ഉപയോഗിച്ച് 300 μL നേർപ്പിക്കുന്നത് വീണ്ടെടുക്കൽ കാര്യക്ഷമത മെച്ചപ്പെടുത്താൻ സഹായിക്കും.
2. ബഫർ ജിഡിപിയുടെ 5 വോള്യങ്ങൾ ചേർക്കുക, ഇൻവെർട്ടിംഗ് അല്ലെങ്കിൽ വോർട്ടക്സിംഗ് വഴി നന്നായി മിക്സ് ചെയ്യുക.താൽപ്പര്യമുള്ള DNA ശകലം>100 bp ആണെങ്കിൽ, അധികമായി 1.5 വോള്യങ്ങൾ (സാമ്പിളുകൾ + ബഫർ GDP) എത്തനോൾ ചേർക്കേണ്ടതുണ്ട്.
3. കളക്ഷൻ ട്യൂബിലേക്ക് കോളം തിരികെ ചേർക്കുക, മിക്സ്ട്രൂ കോളത്തിലേക്ക് മാറ്റുക, 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ (13,800 ×g) സെൻട്രിഫ്യൂജ് 30 - 60 സെക്കൻ്റ്.മിശ്രിത ലായനിയുടെ അളവ്>700 µL ആണെങ്കിൽ, അഡ്സോർപ്ഷൻ കോളം വീണ്ടും ശേഖരണ ട്യൂബിലേക്ക് ഇടുക, ശേഷിക്കുന്ന പരിഹാരം അഡ്സോർപ്ഷൻ കോളത്തിലേക്ക് മാറ്റുക, 30 - 60 സെക്കൻഡ് നേരത്തേക്ക് 12,000 ആർപിഎമ്മിൽ (13,800 × g) സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക.
4. അടുത്ത പ്രകടനം 08- 1/ജെൽ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ പ്രോഗ്രാമിൻ്റെ 5 - 8 ഘട്ടത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.
അപേക്ഷകൾ
TAE അല്ലെങ്കിൽ TBE അഗറോസ് ജെലിൻ്റെ വിവിധ സാന്ദ്രതകൾ;പിസിആർ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ, എൻസൈമാറ്റിക് റിയാക്ഷൻ സിസ്റ്റങ്ങൾ അല്ലെങ്കിൽ വിവിധ രീതികളിലൂടെ ലഭിച്ച മറ്റ് ക്രൂഡ് ഡിഎൻഎ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ.വീണ്ടെടുത്ത ശകലങ്ങൾ മുതൽ70 ബിപി -20 കെബി.
കുറിപ്പുകൾ
ഗവേഷണ ഉപയോഗത്തിന് മാത്രം.ഡയഗ്നോസ്റ്റിക് നടപടിക്രമങ്ങളിൽ ഉപയോഗിക്കാനുള്ളതല്ല.
1. ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് ടാഗിൽ സൂചിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ ബഫർ GW നേർപ്പിക്കാൻ 80 മില്ലി എത്തനോൾ ചേർക്കുക, ഊഷ്മാവിൽ സൂക്ഷിക്കുക.
2. താഴ്ന്ന ഊഷ്മാവിൽ സംഭരണ സമയത്ത് ബഫർ ജിഡിപി അടിഞ്ഞുകൂടാൻ എളുപ്പമാണെങ്കിൽ, അത് ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് ഒരു നിശ്ചിത സമയത്തേക്ക് ഊഷ്മാവിൽ സ്ഥാപിക്കാവുന്നതാണ്.ആവശ്യമെങ്കിൽ, അവശിഷ്ടം പൂർണ്ണമായും അലിഞ്ഞുപോകുന്നതുവരെ ഇത് 37 ℃ വാട്ടർ ബാത്തിൽ ചൂടാക്കാം, തുടർന്ന് ഇത് കലക്കിയ ശേഷം ഉപയോഗിക്കാം.
3. വാട്ടർ ബാത്ത് താപനില മുൻകൂട്ടി 50 ~55℃ ആയി സജ്ജമാക്കുക.
4. 08-1/ജെൽ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ പ്രോഗ്രാം സ്റ്റെപ്പ് 1-ൽ, ജെൽ സ്ലൈസിൻ്റെ വലുപ്പം കുറയ്ക്കുന്നത് അലിഞ്ഞുപോകുന്ന സമയം ഗണ്യമായി കുറയ്ക്കുകയും വീണ്ടെടുക്കൽ കാര്യക്ഷമത വർദ്ധിപ്പിക്കുകയും ചെയ്യും (ഉയർന്ന താപനിലയിൽ തുടർച്ചയായി തുറന്നുകാട്ടപ്പെടുമ്പോൾ ലീനിയറൈസ്ഡ് ഡിഎൻഎ ഹൈഡ്രോലൈസ് ചെയ്യാൻ എളുപ്പമാണ്).അൾട്രാവയലറ്റ് രശ്മികൾ ഡിഎൻഎയ്ക്ക് കേടുപാടുകൾ വരുത്തുമെന്നതിനാൽ, ഡിഎൻഎ ജെൽ അൾട്രാവയലിലേക്ക് ദീർഘനേരം തുറന്നുകാട്ടരുത്.
5. 08- 1/ജെൽ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ പ്രോഗ്രാം സ്റ്റെപ്പ് 2-ൽ ജെൽ പൂർണ്ണമായും അലിയിക്കുക, അല്ലാത്തപക്ഷം ഡിഎൻഎ വീണ്ടെടുക്കൽ കാര്യക്ഷമതയെ ഗുരുതരമായി ബാധിക്കും.
6. ഡിഎൻഎ എല്യൂഷൻ കാര്യക്ഷമത മെച്ചപ്പെടുത്താൻ സഹായകമായ എലൂഷൻ ബഫർ അല്ലെങ്കിൽ ddH2O 55℃ വരെ ചൂടാക്കുക.2.5 mM Tris-HCl, pH 7.0 - 8.5 എല്യൂയൻ്റിൽ ഡിഎൻഎ സംഭരിക്കാൻ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു.